正气是中医学中最重要、最基本的概念之一。它是指人体的机能活动（包括脏腑、经络、气血等功能）和抗病、康复能力而言，通常简称为“正”。
　　免疫是现代医学的基本概念。所谓免疫，指机体的免疫系统识别“自己”与“非己”成分，并排斥异构物质的生理功能。其主要功能有以下三方面：①防御作用，即抗感染免疫，主要指对病原微生物的免疫作用，作用过强时表现为变态反应；②维持机体内在平衡，如去除老死或受损伤的细胞，作用过强时表现为自身免疫病；③免疫监督，即去除经常在体内发生的异常细胞变种，当作用减弱，如老年人，就容易出现恶性肿瘤。
　　正气的功能包括免疫这一重要的功能活动。如上所述，正气与免疫分别是两种医学体系中的基本概念，两者之间有着内在的联系。从免疫的主要功能来看，大致相当于正气的抗病能力。中医学认为，正气亏虚是疾病发生的内在根据，因此，非常重视人体正气在疾病发生过程中的重要作用。正气充盛，抗病力强，致病邪气难以侵袭，疾病也就无从发生。《素问·刺法论》说：“正气存内，邪不可干”。反之，当人体正气不足，或正气相对虚弱时，卫外功能低下，往往抗邪无力，则邪气可能乘虚而入，导致机体阴阳失调，脏腑经络功能紊乱，以致引发疾病。故《素问·评热病论》说：“邪之所凑，其气必虚”。正气抗御外邪入侵的这一功能，与免疫功能的防御作用，即抵御病原微生物感染的作用相当。正气的抗病能力还表现为维持脏腑功能的协调、气血的流行畅达。在中医病因学中，特别注意内生邪气，如痰饮、瘀血以及内生五邪等。上述邪气，往往是脏腑功能失调，气血失和的病理产物，又反过来影响人体，导致疾病的发生。《丹溪心法》谓：“气血冲和，百病不生。一有怫郁，诸病生焉，故人身诸病多生于郁”。郁是诸多疾病自身而生的关键环节，故前人有“百病皆兼郁”的论断。郁是气血失于冲和的病理状态，若脏腑协调、气血冲和，则郁不能存在，而诸病亦皆难生。正气的这一功能则与免疫功能中的维持机体内在平衡的功能相吻和。正气失常可以致病，而免疫过强则可导致自身免疫病的发生，如常见的结缔组织疾病、肾小球肾炎、肾病综合症等。一旦体内产生了上述病理产物，人体的正气又会奋起而抵抗之。如果正气不足，而这些病理产物又难以迅速除尽，必然会导致邪气愈结愈甚，同时正气因之而耗伤，甚则危及生命。如积证的发生，常常因为情志失调，饮食失节，或感外邪，以致气机郁滞，血行不畅，瘀血内阻，结而成块，积渐而大，终至不治。《素问·经脉别论》曰：“当是之时，勇者气行则已，怯者则着而病也”。这种预防或消除体内病理产物的形成、堆积的功能，则与免疫监督相当。因此，可以说，中医学正气的抗病能力，包括免疫这一生理功能，但正气只是从整体、宏观的角度阐释了人体免疫功能的大致内容，至于微观、局部的内容，是正气学说所不能阐述清楚的。
　　正气不等于免疫。免疫功能是正气的重要方面，即抗病能力，但却不是正气的全部内容。人体的机能活动是正气主要的、根本的功能，也是抗病能力产生的基础。人体的机能活动以脏腑为场所，而脏腑之中又以五脏为中心，五脏的功能活动产生了气血，气血又是脏腑功能活动的物质基础。脏腑的相互联系、脏腑与其它组织器官的关联、气血的运行又以经络为路径。脏腑、经络、气血功能活动既是正气的内容之一，同时，其功能活动又产生正气。正气旺盛则抗病能力强。任何疾病的发生，都必然是脏腑、经络、气血功能的失调，病程久延，还会导致脏腑、经络、气血的损伤，即正气亏虚，因此，在疾病过程中，邪正斗争的同时，或邪去之后，都存在着正气的自我恢复，从而使机体康复的过程。这种自我修复的机能，通称康复能力，它同样是正气的重要组成部分。这些虽与抗病能力不同，但两者之间却有着密切的联系。抗病能力、康复能力都以脏腑、经络、气血的功能为基础，都与疾病过程有关，但抗病能力与疾病的发生、发展相关，而康复能力则与疾病的痊愈相关。这些都不是免疫这一生理功能所能概括的。