一般患者可在门诊治疗，严重者可收入院治疗。解释病情，消除紧张情况情绪，必要时给经镇剂，如安定0.5mg，口服，1/日。增强胃动力(见消化性溃疡)。抑制胃酸，(见消化性溃疡)。抗幽门螺矸菌(见消化性溃疡)。胃粘膜保护(见消化性溃疡)。

非溃疡性消化不良在治疗时应根据自身的病情采取以下综合性措施：

1.心理治疗

患者当得知自己患了非溃疡性消化不良时，既要把心胸放宽，不要惊恐和紧张，又要积极地配合医生坚持进行正规的治疗。虽然非溃疡性消化不良在短时间内较难彻底治愈，但它绝对不会出现严重的不良后果，更不会发展为胃癌。作为病情严重的该病患者还可在医生的指导下选用调节精神的药物，如阿米替林、多虑平、马普替林(路滴美)、氟西汀、氯米帕明、安定、谷维素、芬那露和柏子养心丸等。

2.用胃肠推动药该类药物

主要包括：①吗丁啉(又名多潘力酮)：该药能增强胃肠的蠕动，促进胃的排空，从而可以调节或恢复患者胃肠道的正常活动，使食物能够顺利地进入十二指肠，这对于消除由非溃疡性消化不良产生的症状十分有效。

②普瑞博思(又名西沙必利)：该药是新一代胃肠推动药，其作用与吗丁啉相同，但疗效比吗丁啉高3～4倍，故它已成为目前临床上非溃疡性消化不良患者最佳和首选的胃肠推动药。

③胃复安(又名灭吐灵)：该药是一种老的胃肠推动药。非溃疡性消化不良患者在没有吗丁啉和普瑞博思时亦可选用此药。

3.对症治疗

①非溃疡性消化不良患者若出现上腹痛可选用溴必利、普鲁本辛、颠茄片、阿托品或654-2等药物进行治疗;

②若出现腹胀、嗳气症状可选用二甲基硅油或消胀片等药物进行治疗;

③若出现恶心、呕吐症状可选用维生素B。或吐来抗等药物进行治疗;

④若出现烧心、反酸症状可选用胃舒平、雷尼替丁、法莫替丁、洛赛克或甲氰咪呱等药物进行治疗。