首选乙胺嗪(海群生)，广泛用于抗丝虫感染。可直接杀伤成虫和微丝虫，其疗效对马来丝虫病较斑丝虫病好，但不良反应前者较后者重，每天6～12mg/kg，分3次口服，口服吸收迅速，体内代谢，几乎全部由尿中排出。推荐3周为1个疗程。此药不良反应轻微，偶有恶心、呕吐、头晕、失眠等，治疗期间由于大量杀灭丝虫可引起畏寒、头痛、全身肌肉疼痛、皮疹、甚至喉头水肿等过敏反应要特别注意。大部分病人经3周治疗可痊愈，但可急性复发，继续应用仍然有效。若用乙胺嗪治疗仍有持续性呼吸道症状、放射线异常、血液和血清学异常，则说明慢性炎症持续存在，已发展为慢性间质性肺疾病。用标准疗程治疗后随访2～5年，约有139例其中6例的病人有持续性症状，BALF中嗜酸粒细胞轻度持续性增高。慢性病人对治疗反应不佳。改用其他的抗丝虫药(如伊维菌素)或试用糖皮质激素往往有效。也可用砷剂如卡巴砷，每天400～600mg，分2～3次给药，10天为1个疗程。必要时停用10天后再进行第2个疗程。

经上述治疗无效者，可试用卡巴砷(亚乙酰拉砷)0.75mg肌注，2次/周，4～8次为1个疗程，开始2次剂量宜小，若出现血尿应立即停药。其他的抗丝虫药还有左旋咪唑，每天150～200mg，分2次口服，但不良反应较乙胺嗪(海群生)大。呋喃嘧酮对斑丝虫和微丝蚴均有显著的杀灭作用，剂量每天20mg/kg，分2～3次口服，7天为1个疗程。未经治疗的病人症状通常持续几周到几个月，可自行缓解，但常在几个月或几年复发。本病预后良好，绝大多数能治愈。已发展为纤维化者，治疗效果不佳。